Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR6

Rbbp8, DNA endonuclease RBBP8, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8Q80YR6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp8Q80YR6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp8Q80YR6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp8Q80YR6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp8Q80YR6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp8Q80YR6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp8Q80YR6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp8Q80YR6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp8Q80YR6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp8Q80YR6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp8Q80YR6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp8Q80YR6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp8Q80YR6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp8Q80YR6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp8Q80YR6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp8Q80YR6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp8Q80YR6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp8Q80YR6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp8Q80YR6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp8Q80YR6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbbp8Q80YR6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbbp8Q80YR6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbbp8Q80YR6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbbp8Q80YR6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbbp8Q80YR6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbbp8Q80YR6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbbp8Q80YR6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbbp8Q80YR6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbbp8Q80YR6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbbp8Q80YR6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbbp8Q80YR6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbbp8Q80YR6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbbp8Q80YR6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbbp8Q80YR6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbbp8Q80YR6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbbp8Q80YR6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbbp8Q80YR6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbbp8Q80YR6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbbp8Q80YR6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbbp8Q80YR6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbbp8Q80YR6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbbp8Q80YR6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbbp8Q80YR6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbbp8Q80YR6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbbp8Q80YR6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbbp8Q80YR6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbbp8Q80YR6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbbp8Q80YR6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbbp8Q80YR6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbbp8Q80YR6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbbp8Q80YR6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbbp8Q80YR6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbbp8Q80YR6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbbp8Q80YR6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbbp8Q80YR6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbbp8Q80YR6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbbp8Q80YR6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbbp8Q80YR6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbbp8Q80YR6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbbp8Q80YR6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbbp8Q80YR6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rbbp8Q80YR6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rbbp8Q80YR6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rbbp8Q80YR6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rbbp8Q80YR6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rbbp8Q80YR6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Rbbp8Q80YR6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbbp8Q80YR6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbbp8Q80YR6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbbp8Q80YR6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbbp8Q80YR6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbbp8Q80YR6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbbp8Q80YR6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbbp8Q80YR6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbbp8Q80YR6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbbp8Q80YR6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbbp8Q80YR6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbbp8Q80YR6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbbp8Q80YR6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbbp8Q80YR6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp8Q80YR6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp8Q80YR6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp8Q80YR6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp8Q80YR6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp8Q80YR6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp8Q80YR6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp8Q80YR6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp8Q80YR6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp8Q80YR6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp8Q80YR6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp8Q80YR6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp8Q80YR6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp8Q80YR6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp8Q80YR6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp8Q80YR6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp8Q80YR6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp8Q80YR6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp8Q80YR6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp8Q80YR6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbbp8Q80YR6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms