Protein–RNA interactions for Protein: Q80YF6

Upk3b, Uroplakin-3b, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3bQ80YF6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk3bQ80YF6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Upk3bQ80YF6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms