Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Kdm5bQ80Y84 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Kdm5bQ80Y84 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Kdm5bQ80Y84 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kdm5bQ80Y84 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kdm5bQ80Y84 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kdm5bQ80Y84 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kdm5bQ80Y84 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kdm5bQ80Y84 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kdm5bQ80Y84 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kdm5bQ80Y84 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kdm5bQ80Y84 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kdm5bQ80Y84 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kdm5bQ80Y84 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kdm5bQ80Y84 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Kdm5bQ80Y84 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kdm5bQ80Y84 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kdm5bQ80Y84 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kdm5bQ80Y84 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kdm5bQ80Y84 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kdm5bQ80Y84 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kdm5bQ80Y84 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kdm5bQ80Y84 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kdm5bQ80Y84 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kdm5bQ80Y84 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Kdm5bQ80Y84 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Kdm5bQ80Y84 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Kdm5bQ80Y84 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Kdm5bQ80Y84 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Kdm5bQ80Y84 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Kdm5bQ80Y84 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Kdm5bQ80Y84 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Kdm5bQ80Y84 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kdm5bQ80Y84 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kdm5bQ80Y84 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kdm5bQ80Y84 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kdm5bQ80Y84 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kdm5bQ80Y84 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Kdm5bQ80Y84 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kdm5bQ80Y84 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kdm5bQ80Y84 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kdm5bQ80Y84 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kdm5bQ80Y84 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kdm5bQ80Y84 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Kdm5bQ80Y84 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Kdm5bQ80Y84 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Kdm5bQ80Y84 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Kdm5bQ80Y84 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Kdm5bQ80Y84 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Kdm5bQ80Y84 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Kdm5bQ80Y84 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Kdm5bQ80Y84 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Kdm5bQ80Y84 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Kdm5bQ80Y84 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Kdm5bQ80Y84 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Kdm5bQ80Y84 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Kdm5bQ80Y84 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Kdm5bQ80Y84 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Kdm5bQ80Y84 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Kdm5bQ80Y84 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Kdm5bQ80Y84 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Kdm5bQ80Y84 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Kdm5bQ80Y84 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kdm5bQ80Y84 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kdm5bQ80Y84 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Kdm5bQ80Y84 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Kdm5bQ80Y84 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Kdm5bQ80Y84 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Kdm5bQ80Y84 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Kdm5bQ80Y84 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Kdm5bQ80Y84 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Kdm5bQ80Y84 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Kdm5bQ80Y84 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Kdm5bQ80Y84 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Kdm5bQ80Y84 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Kdm5bQ80Y84 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Kdm5bQ80Y84 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Kdm5bQ80Y84 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Kdm5bQ80Y84 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Kdm5bQ80Y84 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Kdm5bQ80Y84 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Kdm5bQ80Y84 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Kdm5bQ80Y84 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Kdm5bQ80Y84 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Kdm5bQ80Y84 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Kdm5bQ80Y84 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Kdm5bQ80Y84 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Kdm5bQ80Y84 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Kdm5bQ80Y84 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Kdm5bQ80Y84 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Kdm5bQ80Y84 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Kdm5bQ80Y84 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Kdm5bQ80Y84 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Kdm5bQ80Y84 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Kdm5bQ80Y84 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Kdm5bQ80Y84 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Kdm5bQ80Y84 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Kdm5bQ80Y84 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Kdm5bQ80Y84 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Kdm5bQ80Y84 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms