Protein–RNA interactions for Protein: Q80WT0

Jph4, Junctophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jph4Q80WT0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Jph4Q80WT0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Jph4Q80WT0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Jph4Q80WT0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Jph4Q80WT0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Jph4Q80WT0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Jph4Q80WT0 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Jph4Q80WT0 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Jph4Q80WT0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Jph4Q80WT0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Jph4Q80WT0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Jph4Q80WT0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Jph4Q80WT0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Jph4Q80WT0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Jph4Q80WT0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Jph4Q80WT0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Jph4Q80WT0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Jph4Q80WT0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Jph4Q80WT0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Jph4Q80WT0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Jph4Q80WT0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Jph4Q80WT0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Jph4Q80WT0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Jph4Q80WT0 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Jph4Q80WT0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Jph4Q80WT0 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Jph4Q80WT0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Jph4Q80WT0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Jph4Q80WT0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Jph4Q80WT0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Jph4Q80WT0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Jph4Q80WT0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Jph4Q80WT0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Jph4Q80WT0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Jph4Q80WT0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Jph4Q80WT0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Jph4Q80WT0 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Jph4Q80WT0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Jph4Q80WT0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Jph4Q80WT0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Jph4Q80WT0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Jph4Q80WT0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Jph4Q80WT0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Jph4Q80WT0 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Jph4Q80WT0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Jph4Q80WT0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Jph4Q80WT0 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Jph4Q80WT0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Jph4Q80WT0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Jph4Q80WT0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Jph4Q80WT0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Jph4Q80WT0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Jph4Q80WT0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Jph4Q80WT0 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Jph4Q80WT0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Jph4Q80WT0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Jph4Q80WT0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Jph4Q80WT0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Jph4Q80WT0 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Jph4Q80WT0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Jph4Q80WT0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Jph4Q80WT0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Jph4Q80WT0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Jph4Q80WT0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC28■■■□□ 2.07
Jph4Q80WT0 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Jph4Q80WT0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Jph4Q80WT0 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Jph4Q80WT0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Jph4Q80WT0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Jph4Q80WT0 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Jph4Q80WT0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Jph4Q80WT0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Jph4Q80WT0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Jph4Q80WT0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Jph4Q80WT0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Jph4Q80WT0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Jph4Q80WT0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Jph4Q80WT0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Jph4Q80WT0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Jph4Q80WT0 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Jph4Q80WT0 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Jph4Q80WT0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Jph4Q80WT0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Jph4Q80WT0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Jph4Q80WT0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Jph4Q80WT0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Jph4Q80WT0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Jph4Q80WT0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Jph4Q80WT0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Jph4Q80WT0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Jph4Q80WT0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Jph4Q80WT0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Jph4Q80WT0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Jph4Q80WT0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Jph4Q80WT0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Jph4Q80WT0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Jph4Q80WT0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Jph4Q80WT0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Jph4Q80WT0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Jph4Q80WT0 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms