Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zbed4Q80WQ9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zbed4Q80WQ9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zbed4Q80WQ9 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Zbed4Q80WQ9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Zbed4Q80WQ9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zbed4Q80WQ9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zbed4Q80WQ9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Zbed4Q80WQ9 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Zbed4Q80WQ9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zbed4Q80WQ9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zbed4Q80WQ9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zbed4Q80WQ9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zbed4Q80WQ9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Zbed4Q80WQ9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zbed4Q80WQ9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zbed4Q80WQ9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zbed4Q80WQ9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zbed4Q80WQ9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zbed4Q80WQ9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zbed4Q80WQ9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zbed4Q80WQ9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zbed4Q80WQ9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zbed4Q80WQ9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zbed4Q80WQ9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zbed4Q80WQ9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zbed4Q80WQ9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zbed4Q80WQ9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zbed4Q80WQ9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zbed4Q80WQ9 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zbed4Q80WQ9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zbed4Q80WQ9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zbed4Q80WQ9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zbed4Q80WQ9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zbed4Q80WQ9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zbed4Q80WQ9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Zbed4Q80WQ9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zbed4Q80WQ9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zbed4Q80WQ9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Zbed4Q80WQ9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zbed4Q80WQ9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zbed4Q80WQ9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zbed4Q80WQ9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zbed4Q80WQ9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zbed4Q80WQ9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zbed4Q80WQ9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zbed4Q80WQ9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Zbed4Q80WQ9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zbed4Q80WQ9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zbed4Q80WQ9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zbed4Q80WQ9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zbed4Q80WQ9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Zbed4Q80WQ9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Zbed4Q80WQ9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Zbed4Q80WQ9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Zbed4Q80WQ9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zbed4Q80WQ9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Zbed4Q80WQ9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zbed4Q80WQ9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zbed4Q80WQ9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zbed4Q80WQ9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zbed4Q80WQ9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zbed4Q80WQ9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zbed4Q80WQ9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zbed4Q80WQ9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zbed4Q80WQ9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zbed4Q80WQ9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zbed4Q80WQ9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Zbed4Q80WQ9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zbed4Q80WQ9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zbed4Q80WQ9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zbed4Q80WQ9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zbed4Q80WQ9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zbed4Q80WQ9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zbed4Q80WQ9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zbed4Q80WQ9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zbed4Q80WQ9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zbed4Q80WQ9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zbed4Q80WQ9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zbed4Q80WQ9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zbed4Q80WQ9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zbed4Q80WQ9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zbed4Q80WQ9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zbed4Q80WQ9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zbed4Q80WQ9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zbed4Q80WQ9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zbed4Q80WQ9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zbed4Q80WQ9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zbed4Q80WQ9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zbed4Q80WQ9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zbed4Q80WQ9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zbed4Q80WQ9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zbed4Q80WQ9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zbed4Q80WQ9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zbed4Q80WQ9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zbed4Q80WQ9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zbed4Q80WQ9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zbed4Q80WQ9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zbed4Q80WQ9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zbed4Q80WQ9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms