Protein–RNA interactions for Protein: Q80WM4

Hapln4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hapln4Q80WM4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hapln4Q80WM4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hapln4Q80WM4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hapln4Q80WM4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hapln4Q80WM4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hapln4Q80WM4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hapln4Q80WM4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hapln4Q80WM4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hapln4Q80WM4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hapln4Q80WM4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hapln4Q80WM4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hapln4Q80WM4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hapln4Q80WM4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hapln4Q80WM4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hapln4Q80WM4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hapln4Q80WM4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hapln4Q80WM4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hapln4Q80WM4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hapln4Q80WM4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hapln4Q80WM4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hapln4Q80WM4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hapln4Q80WM4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hapln4Q80WM4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hapln4Q80WM4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hapln4Q80WM4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hapln4Q80WM4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hapln4Q80WM4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hapln4Q80WM4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hapln4Q80WM4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hapln4Q80WM4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hapln4Q80WM4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hapln4Q80WM4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hapln4Q80WM4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hapln4Q80WM4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hapln4Q80WM4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hapln4Q80WM4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms