Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pcsk9Q80W65 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Pcsk9Q80W65 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pcsk9Q80W65 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pcsk9Q80W65 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pcsk9Q80W65 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pcsk9Q80W65 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pcsk9Q80W65 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pcsk9Q80W65 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pcsk9Q80W65 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pcsk9Q80W65 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pcsk9Q80W65 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pcsk9Q80W65 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pcsk9Q80W65 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pcsk9Q80W65 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pcsk9Q80W65 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Pcsk9Q80W65 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pcsk9Q80W65 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pcsk9Q80W65 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pcsk9Q80W65 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pcsk9Q80W65 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pcsk9Q80W65 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pcsk9Q80W65 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pcsk9Q80W65 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pcsk9Q80W65 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Pcsk9Q80W65 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Pcsk9Q80W65 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pcsk9Q80W65 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pcsk9Q80W65 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pcsk9Q80W65 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pcsk9Q80W65 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pcsk9Q80W65 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pcsk9Q80W65 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pcsk9Q80W65 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pcsk9Q80W65 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pcsk9Q80W65 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pcsk9Q80W65 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pcsk9Q80W65 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pcsk9Q80W65 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pcsk9Q80W65 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pcsk9Q80W65 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pcsk9Q80W65 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pcsk9Q80W65 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pcsk9Q80W65 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pcsk9Q80W65 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pcsk9Q80W65 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pcsk9Q80W65 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pcsk9Q80W65 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pcsk9Q80W65 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pcsk9Q80W65 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pcsk9Q80W65 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pcsk9Q80W65 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pcsk9Q80W65 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pcsk9Q80W65 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pcsk9Q80W65 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pcsk9Q80W65 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pcsk9Q80W65 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Pcsk9Q80W65 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pcsk9Q80W65 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pcsk9Q80W65 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pcsk9Q80W65 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pcsk9Q80W65 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pcsk9Q80W65 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pcsk9Q80W65 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
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Pcsk9Q80W65 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Pcsk9Q80W65 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pcsk9Q80W65 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
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Pcsk9Q80W65 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pcsk9Q80W65 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pcsk9Q80W65 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pcsk9Q80W65 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pcsk9Q80W65 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pcsk9Q80W65 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pcsk9Q80W65 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pcsk9Q80W65 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pcsk9Q80W65 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pcsk9Q80W65 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pcsk9Q80W65 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pcsk9Q80W65 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Pcsk9Q80W65 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pcsk9Q80W65 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pcsk9Q80W65 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pcsk9Q80W65 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pcsk9Q80W65 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pcsk9Q80W65 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pcsk9Q80W65 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pcsk9Q80W65 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pcsk9Q80W65 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pcsk9Q80W65 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Pcsk9Q80W65 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pcsk9Q80W65 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pcsk9Q80W65 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pcsk9Q80W65 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pcsk9Q80W65 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pcsk9Q80W65 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Pcsk9Q80W65 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pcsk9Q80W65 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms