Protein–RNA interactions for Protein: Q80UK0

Sestd1, SEC14 domain and spectrin repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sestd1Q80UK0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sestd1Q80UK0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sestd1Q80UK0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sestd1Q80UK0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sestd1Q80UK0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sestd1Q80UK0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sestd1Q80UK0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Sestd1Q80UK0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sestd1Q80UK0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sestd1Q80UK0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sestd1Q80UK0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sestd1Q80UK0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sestd1Q80UK0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sestd1Q80UK0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sestd1Q80UK0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sestd1Q80UK0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sestd1Q80UK0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sestd1Q80UK0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sestd1Q80UK0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sestd1Q80UK0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sestd1Q80UK0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sestd1Q80UK0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sestd1Q80UK0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sestd1Q80UK0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sestd1Q80UK0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sestd1Q80UK0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sestd1Q80UK0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sestd1Q80UK0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Sestd1Q80UK0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sestd1Q80UK0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sestd1Q80UK0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sestd1Q80UK0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sestd1Q80UK0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sestd1Q80UK0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sestd1Q80UK0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sestd1Q80UK0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sestd1Q80UK0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sestd1Q80UK0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sestd1Q80UK0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sestd1Q80UK0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Sestd1Q80UK0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sestd1Q80UK0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sestd1Q80UK0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sestd1Q80UK0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sestd1Q80UK0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sestd1Q80UK0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sestd1Q80UK0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sestd1Q80UK0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sestd1Q80UK0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sestd1Q80UK0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sestd1Q80UK0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sestd1Q80UK0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sestd1Q80UK0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sestd1Q80UK0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sestd1Q80UK0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sestd1Q80UK0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sestd1Q80UK0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sestd1Q80UK0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sestd1Q80UK0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sestd1Q80UK0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sestd1Q80UK0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sestd1Q80UK0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sestd1Q80UK0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sestd1Q80UK0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sestd1Q80UK0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Sestd1Q80UK0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Sestd1Q80UK0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sestd1Q80UK0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sestd1Q80UK0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sestd1Q80UK0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sestd1Q80UK0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sestd1Q80UK0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sestd1Q80UK0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms