Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Avl9Q80U56 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Avl9Q80U56 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Avl9Q80U56 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Avl9Q80U56 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Avl9Q80U56 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Avl9Q80U56 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Avl9Q80U56 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Avl9Q80U56 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Avl9Q80U56 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Avl9Q80U56 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Avl9Q80U56 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Avl9Q80U56 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Avl9Q80U56 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Avl9Q80U56 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Avl9Q80U56 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Avl9Q80U56 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Avl9Q80U56 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Avl9Q80U56 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Avl9Q80U56 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Avl9Q80U56 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Avl9Q80U56 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Avl9Q80U56 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Avl9Q80U56 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Avl9Q80U56 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Avl9Q80U56 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Avl9Q80U56 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Avl9Q80U56 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Avl9Q80U56 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Avl9Q80U56 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Avl9Q80U56 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Avl9Q80U56 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Avl9Q80U56 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Avl9Q80U56 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Avl9Q80U56 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Avl9Q80U56 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Avl9Q80U56 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Avl9Q80U56 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Avl9Q80U56 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Avl9Q80U56 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Avl9Q80U56 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Avl9Q80U56 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Avl9Q80U56 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Avl9Q80U56 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Avl9Q80U56 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Avl9Q80U56 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Avl9Q80U56 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Avl9Q80U56 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Avl9Q80U56 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Avl9Q80U56 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Avl9Q80U56 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Avl9Q80U56 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Avl9Q80U56 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Avl9Q80U56 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Avl9Q80U56 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Avl9Q80U56 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Avl9Q80U56 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Avl9Q80U56 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Avl9Q80U56 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Avl9Q80U56 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Avl9Q80U56 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Avl9Q80U56 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Avl9Q80U56 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Avl9Q80U56 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Avl9Q80U56 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Avl9Q80U56 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Avl9Q80U56 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Avl9Q80U56 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Avl9Q80U56 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Avl9Q80U56 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Avl9Q80U56 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms