Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms