Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zfp397Q7TNK4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zfp397Q7TNK4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zfp397Q7TNK4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zfp397Q7TNK4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Zfp397Q7TNK4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zfp397Q7TNK4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zfp397Q7TNK4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zfp397Q7TNK4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zfp397Q7TNK4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Zfp397Q7TNK4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zfp397Q7TNK4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zfp397Q7TNK4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zfp397Q7TNK4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zfp397Q7TNK4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Zfp397Q7TNK4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Zfp397Q7TNK4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zfp397Q7TNK4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zfp397Q7TNK4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zfp397Q7TNK4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zfp397Q7TNK4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zfp397Q7TNK4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zfp397Q7TNK4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zfp397Q7TNK4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zfp397Q7TNK4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zfp397Q7TNK4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zfp397Q7TNK4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zfp397Q7TNK4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zfp397Q7TNK4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zfp397Q7TNK4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zfp397Q7TNK4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zfp397Q7TNK4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zfp397Q7TNK4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zfp397Q7TNK4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zfp397Q7TNK4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zfp397Q7TNK4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zfp397Q7TNK4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zfp397Q7TNK4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zfp397Q7TNK4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zfp397Q7TNK4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zfp397Q7TNK4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zfp397Q7TNK4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zfp397Q7TNK4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zfp397Q7TNK4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zfp397Q7TNK4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zfp397Q7TNK4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zfp397Q7TNK4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zfp397Q7TNK4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zfp397Q7TNK4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zfp397Q7TNK4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zfp397Q7TNK4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zfp397Q7TNK4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zfp397Q7TNK4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zfp397Q7TNK4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zfp397Q7TNK4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zfp397Q7TNK4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zfp397Q7TNK4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zfp397Q7TNK4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zfp397Q7TNK4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zfp397Q7TNK4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zfp397Q7TNK4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zfp397Q7TNK4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zfp397Q7TNK4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp397Q7TNK4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms