Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nphp3Q7TNH6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nphp3Q7TNH6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nphp3Q7TNH6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Nphp3Q7TNH6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nphp3Q7TNH6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nphp3Q7TNH6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nphp3Q7TNH6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nphp3Q7TNH6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nphp3Q7TNH6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nphp3Q7TNH6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nphp3Q7TNH6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nphp3Q7TNH6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nphp3Q7TNH6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nphp3Q7TNH6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nphp3Q7TNH6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nphp3Q7TNH6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nphp3Q7TNH6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nphp3Q7TNH6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Nphp3Q7TNH6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nphp3Q7TNH6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nphp3Q7TNH6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nphp3Q7TNH6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nphp3Q7TNH6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Nphp3Q7TNH6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nphp3Q7TNH6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nphp3Q7TNH6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nphp3Q7TNH6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nphp3Q7TNH6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nphp3Q7TNH6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nphp3Q7TNH6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nphp3Q7TNH6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nphp3Q7TNH6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nphp3Q7TNH6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nphp3Q7TNH6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nphp3Q7TNH6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nphp3Q7TNH6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nphp3Q7TNH6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Nphp3Q7TNH6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Nphp3Q7TNH6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nphp3Q7TNH6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nphp3Q7TNH6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nphp3Q7TNH6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nphp3Q7TNH6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Nphp3Q7TNH6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nphp3Q7TNH6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nphp3Q7TNH6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nphp3Q7TNH6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nphp3Q7TNH6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nphp3Q7TNH6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nphp3Q7TNH6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nphp3Q7TNH6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nphp3Q7TNH6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nphp3Q7TNH6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nphp3Q7TNH6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nphp3Q7TNH6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nphp3Q7TNH6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Nphp3Q7TNH6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Nphp3Q7TNH6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nphp3Q7TNH6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nphp3Q7TNH6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nphp3Q7TNH6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nphp3Q7TNH6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nphp3Q7TNH6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nphp3Q7TNH6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Nphp3Q7TNH6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Nphp3Q7TNH6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nphp3Q7TNH6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nphp3Q7TNH6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nphp3Q7TNH6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nphp3Q7TNH6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nphp3Q7TNH6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nphp3Q7TNH6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Nphp3Q7TNH6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nphp3Q7TNH6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nphp3Q7TNH6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nphp3Q7TNH6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nphp3Q7TNH6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nphp3Q7TNH6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nphp3Q7TNH6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nphp3Q7TNH6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nphp3Q7TNH6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nphp3Q7TNH6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nphp3Q7TNH6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nphp3Q7TNH6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nphp3Q7TNH6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nphp3Q7TNH6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nphp3Q7TNH6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nphp3Q7TNH6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nphp3Q7TNH6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nphp3Q7TNH6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nphp3Q7TNH6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nphp3Q7TNH6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nphp3Q7TNH6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nphp3Q7TNH6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Nphp3Q7TNH6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nphp3Q7TNH6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nphp3Q7TNH6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nphp3Q7TNH6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nphp3Q7TNH6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms