Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN88

Pkd1l2, Polycystic kidney disease protein 1-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd1l2Q7TN88 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms