Protein–RNA interactions for Protein: Q76N33

Stambpl1, AMSH-like protease, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stambpl1Q76N33 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Stambpl1Q76N33 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Stambpl1Q76N33 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Stambpl1Q76N33 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms