Protein–RNA interactions for Protein: Q70E20

Sned1, Sushi, nidogen and EGF-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sned1Q70E20 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sned1Q70E20 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sned1Q70E20 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sned1Q70E20 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sned1Q70E20 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sned1Q70E20 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sned1Q70E20 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sned1Q70E20 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sned1Q70E20 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sned1Q70E20 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sned1Q70E20 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sned1Q70E20 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sned1Q70E20 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sned1Q70E20 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sned1Q70E20 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sned1Q70E20 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sned1Q70E20 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sned1Q70E20 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sned1Q70E20 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Sned1Q70E20 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sned1Q70E20 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sned1Q70E20 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sned1Q70E20 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sned1Q70E20 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sned1Q70E20 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sned1Q70E20 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sned1Q70E20 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sned1Q70E20 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sned1Q70E20 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Sned1Q70E20 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sned1Q70E20 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sned1Q70E20 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sned1Q70E20 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sned1Q70E20 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sned1Q70E20 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sned1Q70E20 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sned1Q70E20 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sned1Q70E20 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sned1Q70E20 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sned1Q70E20 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sned1Q70E20 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sned1Q70E20 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Sned1Q70E20 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sned1Q70E20 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sned1Q70E20 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Sned1Q70E20 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sned1Q70E20 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sned1Q70E20 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sned1Q70E20 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sned1Q70E20 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sned1Q70E20 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sned1Q70E20 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Sned1Q70E20 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sned1Q70E20 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sned1Q70E20 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sned1Q70E20 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sned1Q70E20 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sned1Q70E20 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Sned1Q70E20 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sned1Q70E20 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sned1Q70E20 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sned1Q70E20 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sned1Q70E20 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sned1Q70E20 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sned1Q70E20 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sned1Q70E20 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Sned1Q70E20 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Sned1Q70E20 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sned1Q70E20 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Sned1Q70E20 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sned1Q70E20 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sned1Q70E20 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sned1Q70E20 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sned1Q70E20 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sned1Q70E20 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sned1Q70E20 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sned1Q70E20 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sned1Q70E20 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sned1Q70E20 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sned1Q70E20 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sned1Q70E20 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sned1Q70E20 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sned1Q70E20 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sned1Q70E20 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sned1Q70E20 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sned1Q70E20 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sned1Q70E20 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sned1Q70E20 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sned1Q70E20 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sned1Q70E20 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sned1Q70E20 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Sned1Q70E20 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Sned1Q70E20 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sned1Q70E20 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sned1Q70E20 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sned1Q70E20 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sned1Q70E20 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sned1Q70E20 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sned1Q70E20 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sned1Q70E20 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms