Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWZ2

Ube2r2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2r2Q6ZWZ2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Ube2r2Q6ZWZ2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ube2r2Q6ZWZ2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms