Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Cnih3Q6ZWS4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnih3Q6ZWS4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms