Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQE4

Nemp1, Nuclear envelope integral membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nemp1Q6ZQE4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nemp1Q6ZQE4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms