Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smpd4Q6ZPR5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms