Protein–RNA interactions for Protein: Q6W8Q3

Pcp4l1, Purkinje cell protein 4-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcp4l1Q6W8Q3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcp4l1Q6W8Q3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcp4l1Q6W8Q3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcp4l1Q6W8Q3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcp4l1Q6W8Q3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcp4l1Q6W8Q3 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcp4l1Q6W8Q3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcp4l1Q6W8Q3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcp4l1Q6W8Q3 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcp4l1Q6W8Q3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcp4l1Q6W8Q3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcp4l1Q6W8Q3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcp4l1Q6W8Q3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcp4l1Q6W8Q3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcp4l1Q6W8Q3 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pcp4l1Q6W8Q3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcp4l1Q6W8Q3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pcp4l1Q6W8Q3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcp4l1Q6W8Q3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcp4l1Q6W8Q3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcp4l1Q6W8Q3 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcp4l1Q6W8Q3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pcp4l1Q6W8Q3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pcp4l1Q6W8Q3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pcp4l1Q6W8Q3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pcp4l1Q6W8Q3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pcp4l1Q6W8Q3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pcp4l1Q6W8Q3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pcp4l1Q6W8Q3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pcp4l1Q6W8Q3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pcp4l1Q6W8Q3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pcp4l1Q6W8Q3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Pcp4l1Q6W8Q3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Pcp4l1Q6W8Q3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Pcp4l1Q6W8Q3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Pcp4l1Q6W8Q3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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