Protein–RNA interactions for Protein: Q6VZZ7

Opn5, Opsin-5, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn5Q6VZZ7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 6.9 ms