Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUP9

Tfap2e, Transcription factor AP-2-epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2eQ6VUP9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tfap2eQ6VUP9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tfap2eQ6VUP9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tfap2eQ6VUP9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tfap2eQ6VUP9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tfap2eQ6VUP9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tfap2eQ6VUP9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tfap2eQ6VUP9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tfap2eQ6VUP9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tfap2eQ6VUP9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tfap2eQ6VUP9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tfap2eQ6VUP9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tfap2eQ6VUP9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tfap2eQ6VUP9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tfap2eQ6VUP9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tfap2eQ6VUP9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tfap2eQ6VUP9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tfap2eQ6VUP9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tfap2eQ6VUP9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tfap2eQ6VUP9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tfap2eQ6VUP9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tfap2eQ6VUP9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tfap2eQ6VUP9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tfap2eQ6VUP9 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tfap2eQ6VUP9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tfap2eQ6VUP9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tfap2eQ6VUP9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tfap2eQ6VUP9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tfap2eQ6VUP9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tfap2eQ6VUP9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tfap2eQ6VUP9 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tfap2eQ6VUP9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tfap2eQ6VUP9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tfap2eQ6VUP9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tfap2eQ6VUP9 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tfap2eQ6VUP9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tfap2eQ6VUP9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tfap2eQ6VUP9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tfap2eQ6VUP9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tfap2eQ6VUP9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tfap2eQ6VUP9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tfap2eQ6VUP9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tfap2eQ6VUP9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tfap2eQ6VUP9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tfap2eQ6VUP9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tfap2eQ6VUP9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tfap2eQ6VUP9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tfap2eQ6VUP9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tfap2eQ6VUP9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tfap2eQ6VUP9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tfap2eQ6VUP9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tfap2eQ6VUP9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tfap2eQ6VUP9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tfap2eQ6VUP9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tfap2eQ6VUP9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tfap2eQ6VUP9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tfap2eQ6VUP9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tfap2eQ6VUP9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tfap2eQ6VUP9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms