Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc88cQ6VGS5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc88cQ6VGS5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc88cQ6VGS5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc88cQ6VGS5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc88cQ6VGS5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc88cQ6VGS5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc88cQ6VGS5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc88cQ6VGS5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc88cQ6VGS5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc88cQ6VGS5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc88cQ6VGS5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc88cQ6VGS5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc88cQ6VGS5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc88cQ6VGS5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc88cQ6VGS5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc88cQ6VGS5 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc88cQ6VGS5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc88cQ6VGS5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc88cQ6VGS5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc88cQ6VGS5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc88cQ6VGS5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc88cQ6VGS5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc88cQ6VGS5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc88cQ6VGS5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc88cQ6VGS5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc88cQ6VGS5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc88cQ6VGS5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc88cQ6VGS5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc88cQ6VGS5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc88cQ6VGS5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc88cQ6VGS5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc88cQ6VGS5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc88cQ6VGS5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc88cQ6VGS5 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc88cQ6VGS5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc88cQ6VGS5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc88cQ6VGS5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc88cQ6VGS5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc88cQ6VGS5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc88cQ6VGS5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc88cQ6VGS5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc88cQ6VGS5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc88cQ6VGS5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc88cQ6VGS5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc88cQ6VGS5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc88cQ6VGS5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc88cQ6VGS5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc88cQ6VGS5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc88cQ6VGS5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc88cQ6VGS5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc88cQ6VGS5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc88cQ6VGS5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc88cQ6VGS5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc88cQ6VGS5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc88cQ6VGS5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc88cQ6VGS5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc88cQ6VGS5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc88cQ6VGS5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc88cQ6VGS5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc88cQ6VGS5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc88cQ6VGS5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc88cQ6VGS5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc88cQ6VGS5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc88cQ6VGS5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc88cQ6VGS5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc88cQ6VGS5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc88cQ6VGS5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc88cQ6VGS5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc88cQ6VGS5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc88cQ6VGS5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc88cQ6VGS5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc88cQ6VGS5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc88cQ6VGS5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc88cQ6VGS5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc88cQ6VGS5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc88cQ6VGS5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc88cQ6VGS5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc88cQ6VGS5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc88cQ6VGS5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc88cQ6VGS5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc88cQ6VGS5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc88cQ6VGS5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc88cQ6VGS5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms