Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2P8

Neil2, Endonuclease 8-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil2Q6R2P8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms