Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q477

Atp2b4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b4Q6Q477 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp2b4Q6Q477 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp2b4Q6Q477 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp2b4Q6Q477 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atp2b4Q6Q477 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atp2b4Q6Q477 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atp2b4Q6Q477 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atp2b4Q6Q477 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp2b4Q6Q477 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp2b4Q6Q477 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp2b4Q6Q477 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp2b4Q6Q477 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp2b4Q6Q477 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp2b4Q6Q477 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp2b4Q6Q477 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp2b4Q6Q477 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp2b4Q6Q477 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp2b4Q6Q477 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp2b4Q6Q477 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp2b4Q6Q477 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp2b4Q6Q477 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp2b4Q6Q477 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp2b4Q6Q477 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp2b4Q6Q477 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp2b4Q6Q477 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp2b4Q6Q477 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp2b4Q6Q477 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp2b4Q6Q477 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp2b4Q6Q477 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp2b4Q6Q477 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp2b4Q6Q477 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp2b4Q6Q477 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp2b4Q6Q477 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp2b4Q6Q477 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp2b4Q6Q477 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp2b4Q6Q477 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp2b4Q6Q477 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp2b4Q6Q477 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp2b4Q6Q477 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp2b4Q6Q477 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp2b4Q6Q477 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp2b4Q6Q477 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp2b4Q6Q477 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp2b4Q6Q477 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp2b4Q6Q477 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp2b4Q6Q477 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp2b4Q6Q477 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp2b4Q6Q477 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp2b4Q6Q477 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp2b4Q6Q477 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp2b4Q6Q477 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp2b4Q6Q477 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp2b4Q6Q477 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp2b4Q6Q477 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp2b4Q6Q477 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp2b4Q6Q477 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp2b4Q6Q477 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp2b4Q6Q477 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp2b4Q6Q477 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp2b4Q6Q477 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp2b4Q6Q477 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp2b4Q6Q477 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp2b4Q6Q477 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp2b4Q6Q477 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp2b4Q6Q477 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp2b4Q6Q477 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp2b4Q6Q477 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp2b4Q6Q477 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp2b4Q6Q477 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp2b4Q6Q477 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp2b4Q6Q477 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp2b4Q6Q477 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp2b4Q6Q477 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp2b4Q6Q477 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp2b4Q6Q477 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp2b4Q6Q477 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp2b4Q6Q477 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp2b4Q6Q477 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp2b4Q6Q477 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp2b4Q6Q477 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp2b4Q6Q477 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp2b4Q6Q477 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp2b4Q6Q477 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp2b4Q6Q477 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp2b4Q6Q477 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp2b4Q6Q477 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp2b4Q6Q477 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp2b4Q6Q477 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp2b4Q6Q477 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp2b4Q6Q477 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp2b4Q6Q477 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp2b4Q6Q477 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp2b4Q6Q477 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp2b4Q6Q477 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp2b4Q6Q477 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp2b4Q6Q477 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp2b4Q6Q477 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp2b4Q6Q477 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp2b4Q6Q477 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp2b4Q6Q477 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms