Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nudcd1Q6PIP5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms