Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDG5

Smarcc2, SWI/SNF complex subunit SMARCC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc2Q6PDG5 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarcc2Q6PDG5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarcc2Q6PDG5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarcc2Q6PDG5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarcc2Q6PDG5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarcc2Q6PDG5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarcc2Q6PDG5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarcc2Q6PDG5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarcc2Q6PDG5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarcc2Q6PDG5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarcc2Q6PDG5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarcc2Q6PDG5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarcc2Q6PDG5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarcc2Q6PDG5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarcc2Q6PDG5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarcc2Q6PDG5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarcc2Q6PDG5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarcc2Q6PDG5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarcc2Q6PDG5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarcc2Q6PDG5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarcc2Q6PDG5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarcc2Q6PDG5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarcc2Q6PDG5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarcc2Q6PDG5 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarcc2Q6PDG5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarcc2Q6PDG5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarcc2Q6PDG5 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarcc2Q6PDG5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarcc2Q6PDG5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarcc2Q6PDG5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarcc2Q6PDG5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarcc2Q6PDG5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarcc2Q6PDG5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarcc2Q6PDG5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarcc2Q6PDG5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarcc2Q6PDG5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarcc2Q6PDG5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarcc2Q6PDG5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarcc2Q6PDG5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarcc2Q6PDG5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarcc2Q6PDG5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarcc2Q6PDG5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarcc2Q6PDG5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarcc2Q6PDG5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarcc2Q6PDG5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarcc2Q6PDG5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarcc2Q6PDG5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarcc2Q6PDG5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarcc2Q6PDG5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarcc2Q6PDG5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarcc2Q6PDG5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarcc2Q6PDG5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smarcc2Q6PDG5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smarcc2Q6PDG5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smarcc2Q6PDG5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smarcc2Q6PDG5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smarcc2Q6PDG5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smarcc2Q6PDG5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Smarcc2Q6PDG5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smarcc2Q6PDG5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smarcc2Q6PDG5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smarcc2Q6PDG5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smarcc2Q6PDG5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smarcc2Q6PDG5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smarcc2Q6PDG5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smarcc2Q6PDG5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smarcc2Q6PDG5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Smarcc2Q6PDG5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Smarcc2Q6PDG5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smarcc2Q6PDG5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Smarcc2Q6PDG5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smarcc2Q6PDG5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Smarcc2Q6PDG5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Smarcc2Q6PDG5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smarcc2Q6PDG5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smarcc2Q6PDG5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smarcc2Q6PDG5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Smarcc2Q6PDG5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smarcc2Q6PDG5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smarcc2Q6PDG5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smarcc2Q6PDG5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Smarcc2Q6PDG5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Smarcc2Q6PDG5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smarcc2Q6PDG5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smarcc2Q6PDG5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Smarcc2Q6PDG5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smarcc2Q6PDG5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smarcc2Q6PDG5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Smarcc2Q6PDG5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Smarcc2Q6PDG5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smarcc2Q6PDG5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smarcc2Q6PDG5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smarcc2Q6PDG5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smarcc2Q6PDG5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smarcc2Q6PDG5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Smarcc2Q6PDG5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smarcc2Q6PDG5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Smarcc2Q6PDG5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smarcc2Q6PDG5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smarcc2Q6PDG5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms