Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mfsd13aQ6PDE8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms