Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8N9

Cyp2d40, Cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 40, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2d40Q6P8N9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cyp2d40Q6P8N9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cyp2d40Q6P8N9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp2d40Q6P8N9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms