Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BC061212Q6P8K3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BC061212Q6P8K3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BC061212Q6P8K3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BC061212Q6P8K3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BC061212Q6P8K3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BC061212Q6P8K3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BC061212Q6P8K3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BC061212Q6P8K3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BC061212Q6P8K3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BC061212Q6P8K3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BC061212Q6P8K3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BC061212Q6P8K3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BC061212Q6P8K3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BC061212Q6P8K3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BC061212Q6P8K3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BC061212Q6P8K3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BC061212Q6P8K3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BC061212Q6P8K3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BC061212Q6P8K3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
BC061212Q6P8K3 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BC061212Q6P8K3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
BC061212Q6P8K3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BC061212Q6P8K3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BC061212Q6P8K3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BC061212Q6P8K3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
BC061212Q6P8K3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BC061212Q6P8K3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BC061212Q6P8K3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BC061212Q6P8K3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BC061212Q6P8K3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BC061212Q6P8K3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BC061212Q6P8K3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BC061212Q6P8K3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BC061212Q6P8K3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BC061212Q6P8K3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BC061212Q6P8K3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BC061212Q6P8K3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BC061212Q6P8K3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BC061212Q6P8K3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BC061212Q6P8K3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BC061212Q6P8K3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BC061212Q6P8K3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BC061212Q6P8K3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BC061212Q6P8K3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BC061212Q6P8K3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BC061212Q6P8K3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BC061212Q6P8K3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BC061212Q6P8K3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BC061212Q6P8K3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BC061212Q6P8K3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BC061212Q6P8K3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BC061212Q6P8K3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BC061212Q6P8K3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BC061212Q6P8K3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BC061212Q6P8K3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms