Protein–RNA interactions for Protein: Q6P7W5

Tsen2, tRNA-splicing endonuclease subunit Sen2, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsen2Q6P7W5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tsen2Q6P7W5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tsen2Q6P7W5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tsen2Q6P7W5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tsen2Q6P7W5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tsen2Q6P7W5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tsen2Q6P7W5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tsen2Q6P7W5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tsen2Q6P7W5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tsen2Q6P7W5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tsen2Q6P7W5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tsen2Q6P7W5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tsen2Q6P7W5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tsen2Q6P7W5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Tsen2Q6P7W5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tsen2Q6P7W5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tsen2Q6P7W5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tsen2Q6P7W5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tsen2Q6P7W5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tsen2Q6P7W5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tsen2Q6P7W5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tsen2Q6P7W5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tsen2Q6P7W5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Tsen2Q6P7W5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tsen2Q6P7W5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tsen2Q6P7W5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tsen2Q6P7W5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Tsen2Q6P7W5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tsen2Q6P7W5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tsen2Q6P7W5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Tsen2Q6P7W5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tsen2Q6P7W5 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tsen2Q6P7W5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tsen2Q6P7W5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tsen2Q6P7W5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tsen2Q6P7W5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tsen2Q6P7W5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Tsen2Q6P7W5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tsen2Q6P7W5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tsen2Q6P7W5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tsen2Q6P7W5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tsen2Q6P7W5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tsen2Q6P7W5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tsen2Q6P7W5 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Tsen2Q6P7W5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Tsen2Q6P7W5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tsen2Q6P7W5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tsen2Q6P7W5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tsen2Q6P7W5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Tsen2Q6P7W5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tsen2Q6P7W5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tsen2Q6P7W5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tsen2Q6P7W5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tsen2Q6P7W5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tsen2Q6P7W5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tsen2Q6P7W5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tsen2Q6P7W5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Tsen2Q6P7W5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tsen2Q6P7W5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tsen2Q6P7W5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tsen2Q6P7W5 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tsen2Q6P7W5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tsen2Q6P7W5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tsen2Q6P7W5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tsen2Q6P7W5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tsen2Q6P7W5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tsen2Q6P7W5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tsen2Q6P7W5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tsen2Q6P7W5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tsen2Q6P7W5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tsen2Q6P7W5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tsen2Q6P7W5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tsen2Q6P7W5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tsen2Q6P7W5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tsen2Q6P7W5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tsen2Q6P7W5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tsen2Q6P7W5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tsen2Q6P7W5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tsen2Q6P7W5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tsen2Q6P7W5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tsen2Q6P7W5 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tsen2Q6P7W5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tsen2Q6P7W5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tsen2Q6P7W5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tsen2Q6P7W5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tsen2Q6P7W5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tsen2Q6P7W5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tsen2Q6P7W5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Tsen2Q6P7W5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Tsen2Q6P7W5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tsen2Q6P7W5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Tsen2Q6P7W5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tsen2Q6P7W5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tsen2Q6P7W5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tsen2Q6P7W5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tsen2Q6P7W5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tsen2Q6P7W5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tsen2Q6P7W5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tsen2Q6P7W5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Tsen2Q6P7W5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms