Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U8

Ccdc148, Coiled-coil domain-containing protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc148Q6P5U8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc148Q6P5U8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc148Q6P5U8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc148Q6P5U8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc148Q6P5U8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc148Q6P5U8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc148Q6P5U8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc148Q6P5U8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc148Q6P5U8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc148Q6P5U8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc148Q6P5U8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc148Q6P5U8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc148Q6P5U8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc148Q6P5U8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc148Q6P5U8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc148Q6P5U8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc148Q6P5U8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc148Q6P5U8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc148Q6P5U8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc148Q6P5U8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc148Q6P5U8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc148Q6P5U8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc148Q6P5U8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc148Q6P5U8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc148Q6P5U8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc148Q6P5U8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc148Q6P5U8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc148Q6P5U8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc148Q6P5U8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc148Q6P5U8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc148Q6P5U8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc148Q6P5U8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc148Q6P5U8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc148Q6P5U8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc148Q6P5U8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc148Q6P5U8 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc148Q6P5U8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc148Q6P5U8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc148Q6P5U8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc148Q6P5U8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc148Q6P5U8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc148Q6P5U8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc148Q6P5U8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc148Q6P5U8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc148Q6P5U8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc148Q6P5U8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc148Q6P5U8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc148Q6P5U8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc148Q6P5U8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc148Q6P5U8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc148Q6P5U8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc148Q6P5U8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc148Q6P5U8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc148Q6P5U8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc148Q6P5U8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc148Q6P5U8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc148Q6P5U8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc148Q6P5U8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc148Q6P5U8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc148Q6P5U8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc148Q6P5U8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc148Q6P5U8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc148Q6P5U8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc148Q6P5U8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc148Q6P5U8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc148Q6P5U8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc148Q6P5U8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc148Q6P5U8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc148Q6P5U8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc148Q6P5U8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc148Q6P5U8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc148Q6P5U8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc148Q6P5U8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc148Q6P5U8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc148Q6P5U8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc148Q6P5U8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc148Q6P5U8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc148Q6P5U8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc148Q6P5U8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc148Q6P5U8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc148Q6P5U8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc148Q6P5U8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms