Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZN1

Pprc1, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pprc1Q6NZN1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Pprc1Q6NZN1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pprc1Q6NZN1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pprc1Q6NZN1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pprc1Q6NZN1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pprc1Q6NZN1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pprc1Q6NZN1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pprc1Q6NZN1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pprc1Q6NZN1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Pprc1Q6NZN1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Pprc1Q6NZN1 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Pprc1Q6NZN1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pprc1Q6NZN1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pprc1Q6NZN1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pprc1Q6NZN1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pprc1Q6NZN1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pprc1Q6NZN1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pprc1Q6NZN1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Pprc1Q6NZN1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Pprc1Q6NZN1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pprc1Q6NZN1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pprc1Q6NZN1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pprc1Q6NZN1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pprc1Q6NZN1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pprc1Q6NZN1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pprc1Q6NZN1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pprc1Q6NZN1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Pprc1Q6NZN1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pprc1Q6NZN1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pprc1Q6NZN1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pprc1Q6NZN1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pprc1Q6NZN1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pprc1Q6NZN1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pprc1Q6NZN1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Pprc1Q6NZN1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pprc1Q6NZN1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Pprc1Q6NZN1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pprc1Q6NZN1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pprc1Q6NZN1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pprc1Q6NZN1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pprc1Q6NZN1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pprc1Q6NZN1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pprc1Q6NZN1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pprc1Q6NZN1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pprc1Q6NZN1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pprc1Q6NZN1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pprc1Q6NZN1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pprc1Q6NZN1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pprc1Q6NZN1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pprc1Q6NZN1 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pprc1Q6NZN1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pprc1Q6NZN1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pprc1Q6NZN1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pprc1Q6NZN1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pprc1Q6NZN1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pprc1Q6NZN1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pprc1Q6NZN1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Pprc1Q6NZN1 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pprc1Q6NZN1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pprc1Q6NZN1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Pprc1Q6NZN1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pprc1Q6NZN1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pprc1Q6NZN1 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Pprc1Q6NZN1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pprc1Q6NZN1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pprc1Q6NZN1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pprc1Q6NZN1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pprc1Q6NZN1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pprc1Q6NZN1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pprc1Q6NZN1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Pprc1Q6NZN1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pprc1Q6NZN1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pprc1Q6NZN1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pprc1Q6NZN1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pprc1Q6NZN1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pprc1Q6NZN1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pprc1Q6NZN1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pprc1Q6NZN1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Pprc1Q6NZN1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pprc1Q6NZN1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pprc1Q6NZN1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pprc1Q6NZN1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pprc1Q6NZN1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pprc1Q6NZN1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pprc1Q6NZN1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pprc1Q6NZN1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pprc1Q6NZN1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pprc1Q6NZN1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pprc1Q6NZN1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pprc1Q6NZN1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pprc1Q6NZN1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pprc1Q6NZN1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pprc1Q6NZN1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pprc1Q6NZN1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pprc1Q6NZN1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pprc1Q6NZN1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pprc1Q6NZN1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Pprc1Q6NZN1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pprc1Q6NZN1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pprc1Q6NZN1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms