Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Soga3Q6NZL0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Soga3Q6NZL0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Soga3Q6NZL0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Soga3Q6NZL0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Soga3Q6NZL0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Soga3Q6NZL0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Soga3Q6NZL0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Soga3Q6NZL0 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Soga3Q6NZL0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Soga3Q6NZL0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Soga3Q6NZL0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Soga3Q6NZL0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Soga3Q6NZL0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Soga3Q6NZL0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Soga3Q6NZL0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Soga3Q6NZL0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Soga3Q6NZL0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Soga3Q6NZL0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Soga3Q6NZL0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Soga3Q6NZL0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Soga3Q6NZL0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Soga3Q6NZL0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Soga3Q6NZL0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Soga3Q6NZL0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Soga3Q6NZL0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Soga3Q6NZL0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Soga3Q6NZL0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Soga3Q6NZL0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Soga3Q6NZL0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Soga3Q6NZL0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Soga3Q6NZL0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Soga3Q6NZL0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Soga3Q6NZL0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Soga3Q6NZL0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Soga3Q6NZL0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Soga3Q6NZL0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Soga3Q6NZL0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Soga3Q6NZL0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Soga3Q6NZL0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Soga3Q6NZL0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Soga3Q6NZL0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Soga3Q6NZL0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Soga3Q6NZL0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Soga3Q6NZL0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Soga3Q6NZL0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Soga3Q6NZL0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Soga3Q6NZL0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Soga3Q6NZL0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Soga3Q6NZL0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Soga3Q6NZL0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Soga3Q6NZL0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Soga3Q6NZL0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Soga3Q6NZL0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Soga3Q6NZL0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Soga3Q6NZL0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Soga3Q6NZL0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Soga3Q6NZL0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Soga3Q6NZL0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Soga3Q6NZL0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Soga3Q6NZL0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Soga3Q6NZL0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Soga3Q6NZL0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Soga3Q6NZL0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Soga3Q6NZL0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Soga3Q6NZL0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Soga3Q6NZL0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Soga3Q6NZL0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Soga3Q6NZL0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Soga3Q6NZL0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Soga3Q6NZL0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Soga3Q6NZL0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Soga3Q6NZL0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Soga3Q6NZL0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Soga3Q6NZL0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Soga3Q6NZL0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Soga3Q6NZL0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Soga3Q6NZL0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Soga3Q6NZL0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Soga3Q6NZL0 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Soga3Q6NZL0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Soga3Q6NZL0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Soga3Q6NZL0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Soga3Q6NZL0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Soga3Q6NZL0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Soga3Q6NZL0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Soga3Q6NZL0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Soga3Q6NZL0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Soga3Q6NZL0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Soga3Q6NZL0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Soga3Q6NZL0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Soga3Q6NZL0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Soga3Q6NZL0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Soga3Q6NZL0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Soga3Q6NZL0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Soga3Q6NZL0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Soga3Q6NZL0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Soga3Q6NZL0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Soga3Q6NZL0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Soga3Q6NZL0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms