Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXW6

Rad17, Cell cycle checkpoint protein RAD17, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad17Q6NXW6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rad17Q6NXW6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rad17Q6NXW6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rad17Q6NXW6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rad17Q6NXW6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rad17Q6NXW6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rad17Q6NXW6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Rad17Q6NXW6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rad17Q6NXW6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rad17Q6NXW6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rad17Q6NXW6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rad17Q6NXW6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rad17Q6NXW6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rad17Q6NXW6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rad17Q6NXW6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rad17Q6NXW6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rad17Q6NXW6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rad17Q6NXW6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rad17Q6NXW6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rad17Q6NXW6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Rad17Q6NXW6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Rad17Q6NXW6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rad17Q6NXW6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rad17Q6NXW6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rad17Q6NXW6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rad17Q6NXW6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rad17Q6NXW6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rad17Q6NXW6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rad17Q6NXW6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rad17Q6NXW6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rad17Q6NXW6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rad17Q6NXW6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rad17Q6NXW6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rad17Q6NXW6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rad17Q6NXW6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rad17Q6NXW6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rad17Q6NXW6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rad17Q6NXW6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rad17Q6NXW6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rad17Q6NXW6 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rad17Q6NXW6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Rad17Q6NXW6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rad17Q6NXW6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rad17Q6NXW6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rad17Q6NXW6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rad17Q6NXW6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rad17Q6NXW6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rad17Q6NXW6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Rad17Q6NXW6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rad17Q6NXW6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rad17Q6NXW6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rad17Q6NXW6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rad17Q6NXW6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Rad17Q6NXW6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rad17Q6NXW6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rad17Q6NXW6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rad17Q6NXW6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rad17Q6NXW6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rad17Q6NXW6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rad17Q6NXW6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rad17Q6NXW6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rad17Q6NXW6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rad17Q6NXW6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rad17Q6NXW6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Rad17Q6NXW6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rad17Q6NXW6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Rad17Q6NXW6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rad17Q6NXW6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rad17Q6NXW6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Rad17Q6NXW6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rad17Q6NXW6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rad17Q6NXW6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rad17Q6NXW6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rad17Q6NXW6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rad17Q6NXW6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rad17Q6NXW6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rad17Q6NXW6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rad17Q6NXW6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rad17Q6NXW6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rad17Q6NXW6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rad17Q6NXW6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rad17Q6NXW6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Rad17Q6NXW6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rad17Q6NXW6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rad17Q6NXW6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rad17Q6NXW6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rad17Q6NXW6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rad17Q6NXW6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rad17Q6NXW6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rad17Q6NXW6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rad17Q6NXW6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rad17Q6NXW6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rad17Q6NXW6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rad17Q6NXW6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rad17Q6NXW6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rad17Q6NXW6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rad17Q6NXW6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rad17Q6NXW6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rad17Q6NXW6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rad17Q6NXW6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms