Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF9

Cpsf6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf6Q6NVF9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpsf6Q6NVF9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms