Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HelbQ6NVF4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HelbQ6NVF4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HelbQ6NVF4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HelbQ6NVF4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HelbQ6NVF4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HelbQ6NVF4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HelbQ6NVF4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HelbQ6NVF4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HelbQ6NVF4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HelbQ6NVF4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HelbQ6NVF4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HelbQ6NVF4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HelbQ6NVF4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HelbQ6NVF4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HelbQ6NVF4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HelbQ6NVF4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HelbQ6NVF4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HelbQ6NVF4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HelbQ6NVF4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HelbQ6NVF4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HelbQ6NVF4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HelbQ6NVF4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HelbQ6NVF4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HelbQ6NVF4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HelbQ6NVF4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HelbQ6NVF4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HelbQ6NVF4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HelbQ6NVF4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HelbQ6NVF4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HelbQ6NVF4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HelbQ6NVF4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HelbQ6NVF4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HelbQ6NVF4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HelbQ6NVF4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HelbQ6NVF4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HelbQ6NVF4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HelbQ6NVF4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HelbQ6NVF4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HelbQ6NVF4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HelbQ6NVF4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HelbQ6NVF4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HelbQ6NVF4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HelbQ6NVF4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HelbQ6NVF4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HelbQ6NVF4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HelbQ6NVF4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HelbQ6NVF4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HelbQ6NVF4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
HelbQ6NVF4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
HelbQ6NVF4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HelbQ6NVF4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HelbQ6NVF4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HelbQ6NVF4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HelbQ6NVF4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HelbQ6NVF4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HelbQ6NVF4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HelbQ6NVF4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HelbQ6NVF4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HelbQ6NVF4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HelbQ6NVF4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HelbQ6NVF4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HelbQ6NVF4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HelbQ6NVF4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HelbQ6NVF4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HelbQ6NVF4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HelbQ6NVF4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HelbQ6NVF4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HelbQ6NVF4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HelbQ6NVF4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HelbQ6NVF4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HelbQ6NVF4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HelbQ6NVF4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HelbQ6NVF4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HelbQ6NVF4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HelbQ6NVF4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HelbQ6NVF4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HelbQ6NVF4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HelbQ6NVF4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HelbQ6NVF4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HelbQ6NVF4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HelbQ6NVF4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HelbQ6NVF4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HelbQ6NVF4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HelbQ6NVF4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HelbQ6NVF4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HelbQ6NVF4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HelbQ6NVF4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HelbQ6NVF4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HelbQ6NVF4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HelbQ6NVF4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HelbQ6NVF4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HelbQ6NVF4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HelbQ6NVF4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HelbQ6NVF4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HelbQ6NVF4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HelbQ6NVF4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HelbQ6NVF4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HelbQ6NVF4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HelbQ6NVF4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms