Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SphkapQ6NSW3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SphkapQ6NSW3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SphkapQ6NSW3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SphkapQ6NSW3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SphkapQ6NSW3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SphkapQ6NSW3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SphkapQ6NSW3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SphkapQ6NSW3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SphkapQ6NSW3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
SphkapQ6NSW3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
SphkapQ6NSW3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SphkapQ6NSW3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SphkapQ6NSW3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SphkapQ6NSW3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SphkapQ6NSW3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SphkapQ6NSW3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SphkapQ6NSW3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SphkapQ6NSW3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SphkapQ6NSW3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SphkapQ6NSW3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SphkapQ6NSW3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SphkapQ6NSW3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SphkapQ6NSW3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SphkapQ6NSW3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SphkapQ6NSW3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SphkapQ6NSW3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SphkapQ6NSW3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SphkapQ6NSW3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SphkapQ6NSW3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SphkapQ6NSW3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SphkapQ6NSW3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SphkapQ6NSW3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SphkapQ6NSW3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SphkapQ6NSW3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SphkapQ6NSW3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SphkapQ6NSW3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SphkapQ6NSW3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SphkapQ6NSW3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SphkapQ6NSW3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SphkapQ6NSW3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SphkapQ6NSW3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SphkapQ6NSW3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SphkapQ6NSW3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SphkapQ6NSW3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SphkapQ6NSW3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SphkapQ6NSW3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SphkapQ6NSW3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SphkapQ6NSW3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SphkapQ6NSW3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SphkapQ6NSW3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SphkapQ6NSW3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SphkapQ6NSW3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SphkapQ6NSW3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SphkapQ6NSW3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SphkapQ6NSW3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SphkapQ6NSW3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SphkapQ6NSW3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SphkapQ6NSW3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SphkapQ6NSW3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SphkapQ6NSW3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SphkapQ6NSW3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SphkapQ6NSW3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SphkapQ6NSW3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SphkapQ6NSW3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SphkapQ6NSW3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SphkapQ6NSW3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SphkapQ6NSW3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SphkapQ6NSW3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SphkapQ6NSW3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SphkapQ6NSW3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SphkapQ6NSW3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
SphkapQ6NSW3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SphkapQ6NSW3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SphkapQ6NSW3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SphkapQ6NSW3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SphkapQ6NSW3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SphkapQ6NSW3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SphkapQ6NSW3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SphkapQ6NSW3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SphkapQ6NSW3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SphkapQ6NSW3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SphkapQ6NSW3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SphkapQ6NSW3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SphkapQ6NSW3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SphkapQ6NSW3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SphkapQ6NSW3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SphkapQ6NSW3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SphkapQ6NSW3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SphkapQ6NSW3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SphkapQ6NSW3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SphkapQ6NSW3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SphkapQ6NSW3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SphkapQ6NSW3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SphkapQ6NSW3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SphkapQ6NSW3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SphkapQ6NSW3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SphkapQ6NSW3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SphkapQ6NSW3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SphkapQ6NSW3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms