Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc66Q6NS45 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc66Q6NS45 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc66Q6NS45 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc66Q6NS45 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc66Q6NS45 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc66Q6NS45 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc66Q6NS45 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc66Q6NS45 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc66Q6NS45 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc66Q6NS45 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc66Q6NS45 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc66Q6NS45 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc66Q6NS45 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc66Q6NS45 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc66Q6NS45 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc66Q6NS45 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc66Q6NS45 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc66Q6NS45 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc66Q6NS45 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc66Q6NS45 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc66Q6NS45 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc66Q6NS45 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc66Q6NS45 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc66Q6NS45 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc66Q6NS45 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc66Q6NS45 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc66Q6NS45 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc66Q6NS45 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc66Q6NS45 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc66Q6NS45 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc66Q6NS45 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc66Q6NS45 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc66Q6NS45 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc66Q6NS45 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc66Q6NS45 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc66Q6NS45 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc66Q6NS45 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc66Q6NS45 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc66Q6NS45 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc66Q6NS45 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc66Q6NS45 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc66Q6NS45 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc66Q6NS45 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc66Q6NS45 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc66Q6NS45 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc66Q6NS45 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc66Q6NS45 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc66Q6NS45 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc66Q6NS45 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc66Q6NS45 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc66Q6NS45 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc66Q6NS45 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc66Q6NS45 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc66Q6NS45 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc66Q6NS45 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc66Q6NS45 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc66Q6NS45 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc66Q6NS45 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc66Q6NS45 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc66Q6NS45 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc66Q6NS45 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc66Q6NS45 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc66Q6NS45 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc66Q6NS45 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc66Q6NS45 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc66Q6NS45 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc66Q6NS45 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc66Q6NS45 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc66Q6NS45 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc66Q6NS45 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc66Q6NS45 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc66Q6NS45 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc66Q6NS45 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc66Q6NS45 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc66Q6NS45 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc66Q6NS45 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc66Q6NS45 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc66Q6NS45 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc66Q6NS45 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc66Q6NS45 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc66Q6NS45 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc66Q6NS45 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc66Q6NS45 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc66Q6NS45 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc66Q6NS45 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms