Protein–RNA interactions for Protein: Q6K1E7

Ggnbp1, Gametogenetin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggnbp1Q6K1E7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ggnbp1Q6K1E7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ggnbp1Q6K1E7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ggnbp1Q6K1E7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ggnbp1Q6K1E7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ggnbp1Q6K1E7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ggnbp1Q6K1E7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ggnbp1Q6K1E7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ggnbp1Q6K1E7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ggnbp1Q6K1E7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ggnbp1Q6K1E7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ggnbp1Q6K1E7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ggnbp1Q6K1E7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ggnbp1Q6K1E7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ggnbp1Q6K1E7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ggnbp1Q6K1E7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ggnbp1Q6K1E7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ggnbp1Q6K1E7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ggnbp1Q6K1E7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ggnbp1Q6K1E7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ggnbp1Q6K1E7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ggnbp1Q6K1E7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ggnbp1Q6K1E7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ggnbp1Q6K1E7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ggnbp1Q6K1E7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ggnbp1Q6K1E7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ggnbp1Q6K1E7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ggnbp1Q6K1E7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ggnbp1Q6K1E7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ggnbp1Q6K1E7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ggnbp1Q6K1E7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ggnbp1Q6K1E7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ggnbp1Q6K1E7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ggnbp1Q6K1E7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ggnbp1Q6K1E7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ggnbp1Q6K1E7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ggnbp1Q6K1E7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ggnbp1Q6K1E7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ggnbp1Q6K1E7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ggnbp1Q6K1E7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ggnbp1Q6K1E7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ggnbp1Q6K1E7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ggnbp1Q6K1E7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ggnbp1Q6K1E7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ggnbp1Q6K1E7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ggnbp1Q6K1E7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ggnbp1Q6K1E7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms