Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU7

Cep78, Centrosomal protein of 78 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep78Q6IRU7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cep78Q6IRU7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cep78Q6IRU7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cep78Q6IRU7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cep78Q6IRU7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cep78Q6IRU7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cep78Q6IRU7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cep78Q6IRU7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cep78Q6IRU7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cep78Q6IRU7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cep78Q6IRU7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cep78Q6IRU7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cep78Q6IRU7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cep78Q6IRU7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cep78Q6IRU7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cep78Q6IRU7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cep78Q6IRU7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cep78Q6IRU7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cep78Q6IRU7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cep78Q6IRU7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cep78Q6IRU7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cep78Q6IRU7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cep78Q6IRU7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cep78Q6IRU7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cep78Q6IRU7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cep78Q6IRU7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cep78Q6IRU7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cep78Q6IRU7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cep78Q6IRU7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cep78Q6IRU7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cep78Q6IRU7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cep78Q6IRU7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cep78Q6IRU7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cep78Q6IRU7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cep78Q6IRU7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cep78Q6IRU7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cep78Q6IRU7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cep78Q6IRU7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cep78Q6IRU7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cep78Q6IRU7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cep78Q6IRU7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cep78Q6IRU7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cep78Q6IRU7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cep78Q6IRU7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cep78Q6IRU7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cep78Q6IRU7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cep78Q6IRU7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cep78Q6IRU7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cep78Q6IRU7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cep78Q6IRU7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cep78Q6IRU7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cep78Q6IRU7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cep78Q6IRU7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cep78Q6IRU7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cep78Q6IRU7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cep78Q6IRU7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cep78Q6IRU7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cep78Q6IRU7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cep78Q6IRU7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cep78Q6IRU7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cep78Q6IRU7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cep78Q6IRU7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cep78Q6IRU7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cep78Q6IRU7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep78Q6IRU7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep78Q6IRU7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep78Q6IRU7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep78Q6IRU7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep78Q6IRU7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep78Q6IRU7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep78Q6IRU7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep78Q6IRU7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep78Q6IRU7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep78Q6IRU7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep78Q6IRU7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep78Q6IRU7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cep78Q6IRU7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cep78Q6IRU7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cep78Q6IRU7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cep78Q6IRU7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms