Protein–RNA interactions for Protein: Q6I6G8

Hecw2, E3 ubiquitin-protein ligase HECW2, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw2Q6I6G8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hecw2Q6I6G8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Hecw2Q6I6G8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hecw2Q6I6G8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hecw2Q6I6G8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hecw2Q6I6G8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hecw2Q6I6G8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hecw2Q6I6G8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hecw2Q6I6G8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hecw2Q6I6G8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hecw2Q6I6G8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hecw2Q6I6G8 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hecw2Q6I6G8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hecw2Q6I6G8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hecw2Q6I6G8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hecw2Q6I6G8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hecw2Q6I6G8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hecw2Q6I6G8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hecw2Q6I6G8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hecw2Q6I6G8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hecw2Q6I6G8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hecw2Q6I6G8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hecw2Q6I6G8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Hecw2Q6I6G8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Hecw2Q6I6G8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Hecw2Q6I6G8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hecw2Q6I6G8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hecw2Q6I6G8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hecw2Q6I6G8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Hecw2Q6I6G8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hecw2Q6I6G8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hecw2Q6I6G8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hecw2Q6I6G8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hecw2Q6I6G8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hecw2Q6I6G8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hecw2Q6I6G8 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hecw2Q6I6G8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hecw2Q6I6G8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hecw2Q6I6G8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hecw2Q6I6G8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hecw2Q6I6G8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hecw2Q6I6G8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hecw2Q6I6G8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hecw2Q6I6G8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hecw2Q6I6G8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Hecw2Q6I6G8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hecw2Q6I6G8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hecw2Q6I6G8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hecw2Q6I6G8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hecw2Q6I6G8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hecw2Q6I6G8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hecw2Q6I6G8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hecw2Q6I6G8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hecw2Q6I6G8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Hecw2Q6I6G8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hecw2Q6I6G8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hecw2Q6I6G8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hecw2Q6I6G8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Hecw2Q6I6G8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hecw2Q6I6G8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hecw2Q6I6G8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hecw2Q6I6G8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hecw2Q6I6G8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hecw2Q6I6G8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hecw2Q6I6G8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hecw2Q6I6G8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hecw2Q6I6G8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hecw2Q6I6G8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hecw2Q6I6G8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hecw2Q6I6G8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hecw2Q6I6G8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hecw2Q6I6G8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hecw2Q6I6G8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Hecw2Q6I6G8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hecw2Q6I6G8 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hecw2Q6I6G8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hecw2Q6I6G8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hecw2Q6I6G8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hecw2Q6I6G8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hecw2Q6I6G8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hecw2Q6I6G8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hecw2Q6I6G8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hecw2Q6I6G8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hecw2Q6I6G8 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hecw2Q6I6G8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hecw2Q6I6G8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hecw2Q6I6G8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hecw2Q6I6G8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hecw2Q6I6G8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hecw2Q6I6G8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hecw2Q6I6G8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Hecw2Q6I6G8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hecw2Q6I6G8 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Hecw2Q6I6G8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hecw2Q6I6G8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hecw2Q6I6G8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hecw2Q6I6G8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hecw2Q6I6G8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hecw2Q6I6G8 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hecw2Q6I6G8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms