Protein–RNA interactions for Protein: Q6H1V1

Best3, Bestrophin-3, mousemouse

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Length 669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best3Q6H1V1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Best3Q6H1V1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Best3Q6H1V1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Best3Q6H1V1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Best3Q6H1V1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Best3Q6H1V1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Best3Q6H1V1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Best3Q6H1V1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Best3Q6H1V1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Best3Q6H1V1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Best3Q6H1V1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Best3Q6H1V1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Best3Q6H1V1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Best3Q6H1V1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Best3Q6H1V1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Best3Q6H1V1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Best3Q6H1V1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Best3Q6H1V1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Best3Q6H1V1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Best3Q6H1V1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Best3Q6H1V1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Best3Q6H1V1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Best3Q6H1V1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Best3Q6H1V1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Best3Q6H1V1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Best3Q6H1V1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Best3Q6H1V1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Best3Q6H1V1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Best3Q6H1V1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Best3Q6H1V1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Best3Q6H1V1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Best3Q6H1V1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Best3Q6H1V1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Best3Q6H1V1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Best3Q6H1V1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Best3Q6H1V1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Best3Q6H1V1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Best3Q6H1V1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Best3Q6H1V1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Best3Q6H1V1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Best3Q6H1V1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Best3Q6H1V1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Best3Q6H1V1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Best3Q6H1V1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Best3Q6H1V1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Best3Q6H1V1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Best3Q6H1V1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Best3Q6H1V1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Best3Q6H1V1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Best3Q6H1V1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Best3Q6H1V1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Best3Q6H1V1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Best3Q6H1V1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Best3Q6H1V1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Best3Q6H1V1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Best3Q6H1V1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Best3Q6H1V1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Best3Q6H1V1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Best3Q6H1V1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Best3Q6H1V1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Best3Q6H1V1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Best3Q6H1V1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Best3Q6H1V1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Best3Q6H1V1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Best3Q6H1V1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Best3Q6H1V1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Best3Q6H1V1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Best3Q6H1V1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Best3Q6H1V1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Best3Q6H1V1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Best3Q6H1V1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Best3Q6H1V1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Best3Q6H1V1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Best3Q6H1V1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Best3Q6H1V1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Best3Q6H1V1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Best3Q6H1V1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Best3Q6H1V1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Best3Q6H1V1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Best3Q6H1V1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Best3Q6H1V1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Best3Q6H1V1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Best3Q6H1V1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Best3Q6H1V1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Best3Q6H1V1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Best3Q6H1V1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Best3Q6H1V1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Best3Q6H1V1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Best3Q6H1V1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Best3Q6H1V1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Best3Q6H1V1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Best3Q6H1V1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Best3Q6H1V1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Best3Q6H1V1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Best3Q6H1V1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Best3Q6H1V1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Best3Q6H1V1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Best3Q6H1V1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Best3Q6H1V1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Best3Q6H1V1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms