Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nop58Q6DFW4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nop58Q6DFW4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nop58Q6DFW4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nop58Q6DFW4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nop58Q6DFW4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nop58Q6DFW4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nop58Q6DFW4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nop58Q6DFW4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nop58Q6DFW4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nop58Q6DFW4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nop58Q6DFW4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nop58Q6DFW4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nop58Q6DFW4 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nop58Q6DFW4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nop58Q6DFW4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nop58Q6DFW4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nop58Q6DFW4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nop58Q6DFW4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nop58Q6DFW4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nop58Q6DFW4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nop58Q6DFW4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nop58Q6DFW4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nop58Q6DFW4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nop58Q6DFW4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nop58Q6DFW4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nop58Q6DFW4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nop58Q6DFW4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nop58Q6DFW4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nop58Q6DFW4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nop58Q6DFW4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nop58Q6DFW4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nop58Q6DFW4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nop58Q6DFW4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nop58Q6DFW4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nop58Q6DFW4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nop58Q6DFW4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nop58Q6DFW4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nop58Q6DFW4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nop58Q6DFW4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nop58Q6DFW4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nop58Q6DFW4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nop58Q6DFW4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nop58Q6DFW4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nop58Q6DFW4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nop58Q6DFW4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nop58Q6DFW4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nop58Q6DFW4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Nop58Q6DFW4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nop58Q6DFW4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nop58Q6DFW4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nop58Q6DFW4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nop58Q6DFW4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nop58Q6DFW4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nop58Q6DFW4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nop58Q6DFW4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nop58Q6DFW4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nop58Q6DFW4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nop58Q6DFW4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nop58Q6DFW4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nop58Q6DFW4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nop58Q6DFW4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nop58Q6DFW4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Nop58Q6DFW4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nop58Q6DFW4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nop58Q6DFW4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nop58Q6DFW4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nop58Q6DFW4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nop58Q6DFW4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nop58Q6DFW4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nop58Q6DFW4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nop58Q6DFW4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nop58Q6DFW4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nop58Q6DFW4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nop58Q6DFW4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nop58Q6DFW4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nop58Q6DFW4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nop58Q6DFW4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nop58Q6DFW4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nop58Q6DFW4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nop58Q6DFW4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nop58Q6DFW4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nop58Q6DFW4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nop58Q6DFW4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nop58Q6DFW4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nop58Q6DFW4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nop58Q6DFW4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nop58Q6DFW4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nop58Q6DFW4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Nop58Q6DFW4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Nop58Q6DFW4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nop58Q6DFW4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nop58Q6DFW4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nop58Q6DFW4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nop58Q6DFW4 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nop58Q6DFW4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nop58Q6DFW4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nop58Q6DFW4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nop58Q6DFW4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nop58Q6DFW4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms