Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rftn1Q6A0D4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Rftn1Q6A0D4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rftn1Q6A0D4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rftn1Q6A0D4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rftn1Q6A0D4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rftn1Q6A0D4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rftn1Q6A0D4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rftn1Q6A0D4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Rftn1Q6A0D4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rftn1Q6A0D4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rftn1Q6A0D4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rftn1Q6A0D4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Rftn1Q6A0D4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Rftn1Q6A0D4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rftn1Q6A0D4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rftn1Q6A0D4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rftn1Q6A0D4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rftn1Q6A0D4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rftn1Q6A0D4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rftn1Q6A0D4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rftn1Q6A0D4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rftn1Q6A0D4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rftn1Q6A0D4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rftn1Q6A0D4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rftn1Q6A0D4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rftn1Q6A0D4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rftn1Q6A0D4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Rftn1Q6A0D4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rftn1Q6A0D4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rftn1Q6A0D4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rftn1Q6A0D4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rftn1Q6A0D4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rftn1Q6A0D4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rftn1Q6A0D4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rftn1Q6A0D4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rftn1Q6A0D4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rftn1Q6A0D4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rftn1Q6A0D4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rftn1Q6A0D4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rftn1Q6A0D4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rftn1Q6A0D4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rftn1Q6A0D4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rftn1Q6A0D4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Rftn1Q6A0D4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rftn1Q6A0D4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rftn1Q6A0D4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rftn1Q6A0D4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rftn1Q6A0D4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rftn1Q6A0D4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rftn1Q6A0D4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rftn1Q6A0D4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rftn1Q6A0D4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rftn1Q6A0D4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rftn1Q6A0D4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rftn1Q6A0D4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rftn1Q6A0D4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rftn1Q6A0D4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rftn1Q6A0D4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rftn1Q6A0D4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Rftn1Q6A0D4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rftn1Q6A0D4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rftn1Q6A0D4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms