Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Cep290Q6A078 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
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Cep290Q6A078 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
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Cep290Q6A078 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cep290Q6A078 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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Cep290Q6A078 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Cep290Q6A078 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cep290Q6A078 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cep290Q6A078 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cep290Q6A078 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cep290Q6A078 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cep290Q6A078 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cep290Q6A078 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Cep290Q6A078 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cep290Q6A078 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Cep290Q6A078 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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Cep290Q6A078 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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Cep290Q6A078 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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Cep290Q6A078 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cep290Q6A078 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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Cep290Q6A078 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cep290Q6A078 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Cep290Q6A078 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
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Cep290Q6A078 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cep290Q6A078 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Cep290Q6A078 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cep290Q6A078 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cep290Q6A078 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cep290Q6A078 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cep290Q6A078 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cep290Q6A078 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cep290Q6A078 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cep290Q6A078 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cep290Q6A078 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cep290Q6A078 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Cep290Q6A078 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cep290Q6A078 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cep290Q6A078 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cep290Q6A078 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cep290Q6A078 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cep290Q6A078 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cep290Q6A078 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cep290Q6A078 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cep290Q6A078 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cep290Q6A078 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cep290Q6A078 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cep290Q6A078 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cep290Q6A078 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cep290Q6A078 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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