Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdzrn3Q69ZS0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdzrn3Q69ZS0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdzrn3Q69ZS0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdzrn3Q69ZS0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdzrn3Q69ZS0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdzrn3Q69ZS0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdzrn3Q69ZS0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdzrn3Q69ZS0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdzrn3Q69ZS0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdzrn3Q69ZS0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdzrn3Q69ZS0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdzrn3Q69ZS0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdzrn3Q69ZS0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdzrn3Q69ZS0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdzrn3Q69ZS0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdzrn3Q69ZS0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdzrn3Q69ZS0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdzrn3Q69ZS0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdzrn3Q69ZS0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdzrn3Q69ZS0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdzrn3Q69ZS0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdzrn3Q69ZS0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdzrn3Q69ZS0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdzrn3Q69ZS0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdzrn3Q69ZS0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdzrn3Q69ZS0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdzrn3Q69ZS0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdzrn3Q69ZS0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdzrn3Q69ZS0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdzrn3Q69ZS0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdzrn3Q69ZS0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdzrn3Q69ZS0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdzrn3Q69ZS0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdzrn3Q69ZS0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdzrn3Q69ZS0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdzrn3Q69ZS0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdzrn3Q69ZS0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdzrn3Q69ZS0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdzrn3Q69ZS0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pdzrn3Q69ZS0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pdzrn3Q69ZS0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pdzrn3Q69ZS0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdzrn3Q69ZS0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdzrn3Q69ZS0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdzrn3Q69ZS0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdzrn3Q69ZS0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdzrn3Q69ZS0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdzrn3Q69ZS0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdzrn3Q69ZS0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdzrn3Q69ZS0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdzrn3Q69ZS0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdzrn3Q69ZS0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdzrn3Q69ZS0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdzrn3Q69ZS0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdzrn3Q69ZS0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdzrn3Q69ZS0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdzrn3Q69ZS0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdzrn3Q69ZS0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdzrn3Q69ZS0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdzrn3Q69ZS0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdzrn3Q69ZS0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdzrn3Q69ZS0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdzrn3Q69ZS0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdzrn3Q69ZS0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdzrn3Q69ZS0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdzrn3Q69ZS0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdzrn3Q69ZS0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdzrn3Q69ZS0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdzrn3Q69ZS0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdzrn3Q69ZS0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdzrn3Q69ZS0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdzrn3Q69ZS0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdzrn3Q69ZS0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdzrn3Q69ZS0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdzrn3Q69ZS0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdzrn3Q69ZS0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdzrn3Q69ZS0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdzrn3Q69ZS0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdzrn3Q69ZS0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdzrn3Q69ZS0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdzrn3Q69ZS0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdzrn3Q69ZS0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdzrn3Q69ZS0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdzrn3Q69ZS0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdzrn3Q69ZS0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms