Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms