Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE8

Znf280d, Zinc finger protein 280D, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf280dQ68FE8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf280dQ68FE8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf280dQ68FE8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf280dQ68FE8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf280dQ68FE8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf280dQ68FE8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf280dQ68FE8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf280dQ68FE8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf280dQ68FE8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf280dQ68FE8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf280dQ68FE8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf280dQ68FE8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf280dQ68FE8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf280dQ68FE8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf280dQ68FE8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf280dQ68FE8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf280dQ68FE8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf280dQ68FE8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf280dQ68FE8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf280dQ68FE8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf280dQ68FE8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf280dQ68FE8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf280dQ68FE8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf280dQ68FE8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf280dQ68FE8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf280dQ68FE8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf280dQ68FE8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf280dQ68FE8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf280dQ68FE8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf280dQ68FE8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf280dQ68FE8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf280dQ68FE8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf280dQ68FE8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf280dQ68FE8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf280dQ68FE8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf280dQ68FE8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf280dQ68FE8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf280dQ68FE8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf280dQ68FE8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf280dQ68FE8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf280dQ68FE8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf280dQ68FE8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf280dQ68FE8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf280dQ68FE8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf280dQ68FE8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf280dQ68FE8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf280dQ68FE8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf280dQ68FE8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf280dQ68FE8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf280dQ68FE8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf280dQ68FE8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf280dQ68FE8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf280dQ68FE8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf280dQ68FE8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf280dQ68FE8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf280dQ68FE8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf280dQ68FE8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf280dQ68FE8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf280dQ68FE8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf280dQ68FE8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf280dQ68FE8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf280dQ68FE8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf280dQ68FE8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf280dQ68FE8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf280dQ68FE8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf280dQ68FE8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf280dQ68FE8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf280dQ68FE8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf280dQ68FE8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf280dQ68FE8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf280dQ68FE8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf280dQ68FE8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf280dQ68FE8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf280dQ68FE8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf280dQ68FE8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf280dQ68FE8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf280dQ68FE8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf280dQ68FE8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf280dQ68FE8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf280dQ68FE8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf280dQ68FE8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf280dQ68FE8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf280dQ68FE8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf280dQ68FE8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf280dQ68FE8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf280dQ68FE8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf280dQ68FE8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf280dQ68FE8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf280dQ68FE8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf280dQ68FE8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf280dQ68FE8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf280dQ68FE8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf280dQ68FE8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf280dQ68FE8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf280dQ68FE8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf280dQ68FE8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf280dQ68FE8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf280dQ68FE8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf280dQ68FE8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf280dQ68FE8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms