Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY2

Ino80d, INO80 complex subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80dQ66JY2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ino80dQ66JY2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ino80dQ66JY2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ino80dQ66JY2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ino80dQ66JY2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ino80dQ66JY2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ino80dQ66JY2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ino80dQ66JY2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ino80dQ66JY2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ino80dQ66JY2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ino80dQ66JY2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ino80dQ66JY2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ino80dQ66JY2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ino80dQ66JY2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ino80dQ66JY2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ino80dQ66JY2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ino80dQ66JY2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ino80dQ66JY2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ino80dQ66JY2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ino80dQ66JY2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ino80dQ66JY2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ino80dQ66JY2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ino80dQ66JY2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ino80dQ66JY2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ino80dQ66JY2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ino80dQ66JY2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ino80dQ66JY2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ino80dQ66JY2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ino80dQ66JY2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ino80dQ66JY2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ino80dQ66JY2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ino80dQ66JY2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ino80dQ66JY2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ino80dQ66JY2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ino80dQ66JY2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ino80dQ66JY2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ino80dQ66JY2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ino80dQ66JY2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ino80dQ66JY2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ino80dQ66JY2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ino80dQ66JY2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ino80dQ66JY2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ino80dQ66JY2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ino80dQ66JY2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ino80dQ66JY2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ino80dQ66JY2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ino80dQ66JY2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ino80dQ66JY2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ino80dQ66JY2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ino80dQ66JY2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ino80dQ66JY2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ino80dQ66JY2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ino80dQ66JY2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ino80dQ66JY2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ino80dQ66JY2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ino80dQ66JY2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ino80dQ66JY2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ino80dQ66JY2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ino80dQ66JY2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ino80dQ66JY2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ino80dQ66JY2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ino80dQ66JY2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ino80dQ66JY2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ino80dQ66JY2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ino80dQ66JY2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ino80dQ66JY2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ino80dQ66JY2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ino80dQ66JY2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ino80dQ66JY2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ino80dQ66JY2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ino80dQ66JY2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ino80dQ66JY2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ino80dQ66JY2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ino80dQ66JY2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ino80dQ66JY2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ino80dQ66JY2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ino80dQ66JY2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ino80dQ66JY2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ino80dQ66JY2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ino80dQ66JY2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ino80dQ66JY2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ino80dQ66JY2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ino80dQ66JY2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ino80dQ66JY2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ino80dQ66JY2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ino80dQ66JY2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ino80dQ66JY2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ino80dQ66JY2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ino80dQ66JY2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ino80dQ66JY2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ino80dQ66JY2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ino80dQ66JY2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ino80dQ66JY2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ino80dQ66JY2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ino80dQ66JY2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ino80dQ66JY2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ino80dQ66JY2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ino80dQ66JY2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ino80dQ66JY2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ino80dQ66JY2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms